La recherche montre qu’en début du CP, l’enseignant doit se concentrer sur les correspondances graphèmes-phonèmes : chaque enfant devrait en avoir appris entre 12 et 14 dans les six premières semaines d’école. C’est pourquoi la pédagogie Kalulu se focalise sur le décodage.
Dans Kalulu, chaque correspondance graphème-phonème est introduite de façon explicite. Le logiciel Kalulu s’appuie sur l’ordre rationnel issu de la base de données Manulex (www.manulex.org), un corpus réalisé à partir de 54 livres pour enfants. L’apprentissage commence par les voyelles, puis les consonnes et quelques graphèmes très réguliers comme le ‘ch’. Une fois ces bases maîtrisées, on passe aux phonèmes qui sont représentés par plusieurs graphèmes différents, aux sons complexes, et aux correspondances qui sont plus rares en français.